新的测序方案可能有助于更好地理解疾病
在发表在《自然微生物学》杂志上的一项研究中，来自大学生命科学学院的Fiona Whelan博士发现，通过将标准的宏基因组测序方法与细菌微生物培养结合起来，他们可以更好地了解人类微生物群落。
人类微生物群是寄居在人体上的细菌、真菌、病毒和其他微生物的集合体，通常不会引发问题。然而，有时这些群落可能会发生变化，可能会导致炎症性肠病、肥胖甚至一些癌症等疾病。
微生物群落极其复杂。标准方法如宏基因组学类似于通过在湖中抛入一个大网来采样湖泊的生物多样性，测量其中发现的物种，并假设它们代表了湖中的所有物种。这种新方法被称为富含培养的宏基因组测序，通过先在实验室培养这些群落的细菌成员再进行测量，提供了更大的采样范围。
这项方法始于实验室先前博士生的研究，他们发现肺部和肠道的微生物群是可培养的，为在微生物群研究领域中使用的标准测序技术结合培养铺平了道路。
“这种信息的增加主要是因为富含培养的宏基因组学将微生物群按照它们在培养基上生长的不同组织成不同的有机体，这使得测序和分析比在没有培养的情况下测序群落更加直接。此外，添加培养步骤可以去除可能导致测序问题的人类DNA，” Whelan博士补充道。
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